Yo lo he hecho siguiendo esta página y me ha ido bien:
http://rutaxt.blogspot.com.es/2012/05/como-instalar-matlab-2012-en-linux.html
Lo único malo es que salta publicidad, pero si la minimizamos y no le hacemos caso, no pasa nada.
Aparte de lo explicado en la web anterior, otro paso más que yo he dado es crear un enlace simbólico para lanzar Matlab desde línea de comandos escribiendo sólo "matlab":
sudo ln -s /usr/local/MATLAB/R2012a/bin/matlab /usr/bin
Lo que estamos haciendo es crear un enlace simbólico en la carpeta donde están las aplicaciones (/usr/bin) llamado "matlab" que apunta al script /usr/local/MATLAB/R2012a/bin/matlab
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